ايٿوپيا جي سباتڪيلو، آوش ۾ اينوفيليس مڇرن ۾ جينوم جي وسيع آبادي جينياتي ۽ حشرات جي مزاحمت جي ماليڪيولر نگراني

2012 ۾ جبوتي ۾ دريافت ٿيڻ کان وٺي، ايشيائي اينوفيليس اسٽيفنسي مڇر سڄي آفريڪا جي هارن ۾ پکڙجي ويو آهي. هي حملو ڪندڙ ویکٹر سڄي براعظم ۾ پکڙجي رهيو آهي، جيڪو مليريا ڪنٽرول پروگرامن لاءِ هڪ سنگين خطرو پيدا ڪري رهيو آهي. ویکٹر ڪنٽرول طريقا، جن ۾ جراثيم ڪش سان علاج ٿيل بستري جال ۽ اندروني باقي اسپري شامل آهن، مليريا جي بار کي گهٽائي ڇڏيو آهي. بهرحال، جراثيم ڪش مزاحمتي مڇرن جي وڌندڙ پکيڙ، جنهن ۾ اينوفيليس اسٽيفنسي آبادي شامل آهي، مليريا جي خاتمي جي جاري ڪوششن کي روڪي رهي آهي. آبادي جي جوڙجڪ، آبادي جي وچ ۾ جين جي وهڪري، ۽ جراثيم ڪش مزاحمتي ميوٽيشنز جي ورڇ کي سمجهڻ، مؤثر مليريا ڪنٽرول حڪمت عملين جي رهنمائي لاءِ ضروري آهي.
اسان جي سمجھ کي بهتر بڻائڻ ته اين. اسٽيفنسي HOA ۾ ڪيئن ايترو قائم ٿيو، نون علائقن ۾ ان جي امڪاني پکڙجڻ جي اڳڪٿي ڪرڻ لاءِ اهم آهي. آبادي جي جينياتيات کي آبادي جي جوڙجڪ، جاري چونڊ، ۽ جين جي وهڪري ۾ بصيرت حاصل ڪرڻ لاءِ ویکٹر نسلن جي مطالعي لاءِ وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي18,19. اين. اسٽيفنسي لاءِ، آبادي جي جوڙجڪ ۽ جينوم جي جوڙجڪ جو مطالعو ان جي حملي جي رستي ۽ ڪنهن به موافق ارتقا کي واضح ڪرڻ ۾ مدد ڪري سگهي ٿو جيڪو ان جي ظهور کان وٺي ٿي سگهي ٿو. جين جي وهڪري کان علاوه، چونڊ خاص طور تي اهم آهي ڇاڪاڻ ته اهو حشرات جي مزاحمت سان لاڳاپيل ايليلز جي سڃاڻپ ڪري سگهي ٿو ۽ ان تي روشني وجهي سگهي ٿو ته اهي ايليلز آبادي ۾ ڪيئن پکڙجي رهيا آهن20.
اڄ تائين، حملو ڪندڙ نسل اينوفيليس اسٽيفنسي ۾ حشرات جي مزاحمت جي نشانن ۽ آبادي جينياتيات جي جانچ ڪجهه اميدوار جين تائين محدود ڪئي وئي آهي. آفريڪا ۾ نسل جو ظهور مڪمل طور تي سمجھ ۾ نه آيو آهي، پر هڪ مفروضو اهو آهي ته اهو انسانن يا جانورن پاران متعارف ڪرايو ويو هو. ٻين نظرين ۾ هوا ذريعي ڊگهي فاصلي جي لڏپلاڻ شامل آهي. هن مطالعي ۾ استعمال ٿيندڙ ايٿوپيائي آئسوليٽس آوش سبات ڪلو ۾ گڏ ڪيا ويا، هڪ شهر جيڪو اديس ابابا کان 200 ڪلوميٽر اوڀر ۾ واقع آهي ۽ اديس ابابا کان جبوتي تائين مکيه ٽرانسپورٽ ڪوريڊور تي آهي. آوش سبات ڪلو هڪ اهڙو علائقو آهي جتي مليريا جي منتقلي تمام گهڻي آهي ۽ ان ۾ اينوفيليس اسٽيفنسي جي وڏي آبادي آهي، جيڪا حشرات جي خلاف مزاحمتي هجڻ جي رپورٽ ڪئي وئي آهي، ان کي انوفيليس اسٽيفنسي8 جي آبادي جينياتيات جي مطالعي لاءِ هڪ اهم جڳهه بڻائي ٿي.
ايٿوپيا جي آبادي ۾ گهٽ فريڪوئنسي تي ڪيڙي مار دوا جي مزاحمتي ميوٽيشن kdr L1014F جي سڃاڻپ ڪئي وئي ۽ هندستاني فيلڊ نمونن ۾ ان جي سڃاڻپ نه ڪئي وئي. هي kdr ميوٽيشن پائريٿرائڊس ۽ ڊي ڊي ٽي جي مزاحمت فراهم ڪري ٿي ۽ اڳ ۾ 2016 ۾ هندستان ۽ 2018 ۾ افغانستان ۾ گڏ ڪيل اين. اسٽيفنسي آبادي ۾ ان جي سڃاڻپ ڪئي وئي هئي. 31,32 ٻنهي شهرن ۾ وسيع پائريٿرائڊ مزاحمت جي ثبوتن جي باوجود، هتي تجزيو ڪيل منگلور ۽ بنگلور آبادي ۾ kdr L1014F ميوٽيشن جي سڃاڻپ نه ٿي سگهي. هن SNP کي کڻندڙ ايٿوپيائي آئسوليٽس جو گهٽ تناسب جيڪي هيٽروزيگس هئا اهو ظاهر ڪري ٿو ته ميوٽيشن هن آبادي ۾ تازو پيدا ٿيو. ان جي حمايت آوش ۾ هڪ پوئين مطالعي مان ٿئي ٿي جنهن ۾ هتي تجزيو ڪيل نمونن کان اڳ سال ۾ گڏ ڪيل نمونن ۾ kdr ميوٽيشن جو ڪو به ثبوت نه مليو. 18 اسان اڳ ۾ ئي ساڳئي علائقي/سال مان نمونن جي هڪ سيٽ ۾ ايمپليڪن ڊيٽيڪشن اپروچ استعمال ڪندي هن kdr L1014F ميوٽيشن کي گهٽ فريڪوئنسي تي سڃاڻپ ڪيو هو. 28 نموني جي جڳهن تي فينوٽائپڪ مزاحمت کي ڏنو ويو، هن مزاحمتي نشان جي گهٽ ايليل فريڪوئنسي مان ظاهر ٿئي ٿو ته ٽارگيٽ سائيٽ جي ترميم کان سواءِ ٻيا طريقا هن مشاهدو ڪيل فينوٽائپ لاءِ ذميوار آهن.
هن مطالعي جي هڪ حد جراثيم ڪش جي رد عمل تي فينوٽائپڪ ڊيٽا جي کوٽ آهي. وڌيڪ مطالعي جيڪي پوري جينوم سيڪوئنسنگ (WGS) يا ٽارگيٽڊ ايمپليڪن سيڪوئنسنگ کي حساسيت جي بايو ايسز سان گڏ ڪن ٿا، انهن ميوٽيشنز جي جراثيم ڪش جي رد عمل تي اثر جي جاچ ڪرڻ لاءِ گهربل آهن. اهي نوان غلط فهم SNP جيڪي مزاحمت سان لاڳاپيل ٿي سگهن ٿا انهن کي اعليٰ-ٿرو پُٽ ماليڪيولر ايسز لاءِ نشانو بڻايو وڃي ته جيئن نگراني جي مدد ڪري سگهجي ۽ مزاحمتي فينوٽائپس سان لاڳاپيل امڪاني ميڪانيزم کي سمجهڻ ۽ تصديق ڪرڻ لاءِ فنڪشنل ڪم کي آسان بڻائي سگهجي.
خلاصو، هي مطالعو براعظمن ۾ اينوفيلس مڇر جي آبادي جينياتيات جي گهري سمجھ فراهم ڪري ٿو. مختلف جاگرافيائي علائقن ۾ نمونن جي وڏين ڪوهورن تي پوري جينوم سيڪوئنسنگ (WGS) تجزيي جو اطلاق جين جي وهڪري کي سمجهڻ ۽ حشرات جي مزاحمت جي نشانن جي سڃاڻپ لاءِ اهم هوندو. هي علم عوامي صحت اختيارين کي ویکٹر نگراني ۽ حشرات جي استعمال ۾ باخبر چونڊون ڪرڻ جي قابل بڻائيندو.
اسان هن ڊيٽاسيٽ ۾ ڪاپي نمبر جي تبديلي کي ڳولڻ لاءِ ٻه طريقا استعمال ڪيا. پهرين، اسان هڪ ڪوريج تي ٻڌل طريقو استعمال ڪيو جيڪو جينوم ۾ سڃاڻپ ٿيل CYP جين ڪلسٽرن تي ڌيان ڏنو (ضمني جدول S5). نموني ڪوريج کي گڏ ڪرڻ جي جڳهن تي اوسط ڪيو ويو ۽ چار گروپن ۾ ورهايو ويو: ايٿوپيا، هندستاني فيلڊ، هندستاني ڪالونيون، ۽ پاڪستاني ڪالونيون. هر گروپ لاءِ ڪوريج کي ڪرنل سموٿنگ استعمال ڪندي معمول بڻايو ويو ۽ پوءِ ان گروپ لاءِ وچين جينوم ڪوريج جي کوٽائي جي مطابق پلاٽ ڪيو ويو.