پڇا ڳاڇا

فاسفوريليشن ڪروميٽين سان هسٽون H2A جي وابستگي کي فروغ ڏيندي عربيڊوپسس ۾ ماسٽر گروٿ ريگيوليٽر ڊي ايل اي کي چالو ڪري ٿو.

ڊيلا پروٽين محفوظ آهن ماسٽرواڌ ريگيوليٽرجيڪي اندروني ۽ ماحولياتي اشارن جي جواب ۾ ٻوٽن جي ترقي کي ڪنٽرول ڪرڻ ۾ مرڪزي ڪردار ادا ڪن ٿا. ڊي ايل اي هڪ ٽرانسڪرپشنل ريگيوليٽر جي طور تي ڪم ڪري ٿو ۽ ان جي GRAS ڊومين ذريعي ٽرانسڪرپشن فيڪٽرز (TFs) ۽ هسٽون H2A سان پابند ٿي پروموٽرز کي نشانو بڻائڻ لاءِ ڀرتي ڪيو ويندو آهي. تازين مطالعي مان ظاهر ٿيو آهي ته ڊي ايل اي استحڪام کي ٻن ميڪانيزم ذريعي پوسٽ-ٽرانسليشن طور تي منظم ڪيو ويندو آهي: فيٽو هارمون گبيريلين پاران پيدا ٿيندڙ پوليوبائيڪيٽينيشن، جيڪو ان جي تيز تباهي جو سبب بڻجندو آهي، ۽ ان جي جمع کي وڌائڻ لاءِ ننڍڙن يوبيوائيٽين جهڙين تبديلين (SUMO) جو ڪنجوگيشن. ان کان علاوه، ڊي ايل اي سرگرمي کي متحرڪ طور تي ٻن مختلف گلائڪوسائيليشنز ذريعي منظم ڪيو ويندو آهي: ڊي ايل اي-ٽي ايف رابطي کي O-فيوڪوسيليشن ذريعي وڌايو ويندو آهي پر O-لنڪڊ اين-ايسٽيلگلوڪوسامين (O-GlcNAc) ترميم ذريعي روڪيو ويندو آهي. بهرحال، ڊي ايل اي فاسفوريليشن جو ڪردار واضح ناهي، جيئن پوئين مطالعي متضاد نتيجا ڏيکاريا آهن، انهن کان وٺي جيڪي ڏيکارين ٿا ته فاسفوريليشن ڊي ايل اي جي تباهي کي فروغ ڏئي ٿي يا گهٽائي ٿي ٻين تائين جيڪي ڏيکارين ٿا ته فاسفوريليشن ان جي استحڪام کي متاثر نٿو ڪري. هتي، اسان ريپريسر ۾ فاسفوريليشن سائيٽن جي سڃاڻپ ڪريون ٿا.جي اي 1-3(RGA، AtDELLA) کي ماس اسپيڪٽروميٽري تجزيو ذريعي Arabidopsis thaliana کان پاڪ ڪيو ويو ۽ ڏيکاريو ويو ته PolyS ۽ PolyS/T علائقن تي ٻن RGA پيپٽائڊس جي فاسفوريليشن H2A بائنڊنگ ۽ RGA سرگرمي کي وڌايو. ٽارگيٽ پروموٽرز سان RGA جو تعلق. خاص طور تي، فاسفوريليشن RGA-TF رابطي يا RGA استحڪام کي متاثر نٿو ڪري. اسان جو مطالعو ماليڪيولر ميڪانيزم کي ظاهر ڪري ٿو جنهن ذريعي فاسفوريليشن DELLA سرگرمي کي متاثر ڪري ٿو.
ڊي ايل اي فنڪشن کي منظم ڪرڻ ۾ فاسفوريليشن جي ڪردار کي واضح ڪرڻ لاءِ، اهو ضروري آهي ته ڊي ايل اي فاسفوريليشن سائيٽن کي وييو ۾ سڃاڻيو وڃي ۽ ٻوٽن ۾ فنڪشنل تجزيا ڪيا وڃن. ٻوٽن جي عرق جي لاڳاپي جي صفائي ۽ پوءِ ايم ايس/ايم ايس تجزيو ذريعي، اسان آر جي اي ۾ ڪيترن ئي فاسفورسائٽس جي سڃاڻپ ڪئي. جي اي جي گهٽتائي جي حالتن ۾، آر ايڇ اي فاسفوريليشن وڌي ٿي، پر فاسفوريليشن ان جي استحڪام کي متاثر نٿو ڪري. اهم طور تي، ڪو-آئي پي ۽ چِپ-ڪي پي سي آر ايسز ظاهر ڪيو ته آر جي اي جي پولي ايس/ٽي علائقي ۾ فاسفوريليشن H2A سان ان جي رابطي ۽ ٽارگيٽ پروموٽرز سان ان جي وابستگي کي فروغ ڏئي ٿي، اهو طريقو ظاهر ڪري ٿي جنهن ذريعي فاسفوريليشن آر جي اي فنڪشن کي متاثر ڪري ٿي.
RGA کي LHR1 سب ڊومين جي TF سان رابطي ذريعي ڪروميٽين کي نشانو بڻائڻ لاءِ ڀرتي ڪيو ويندو آهي ۽ پوءِ H2A سان ان جي PolyS/T علائقي ۽ PFYRE سب ڊومين ذريعي ڳنڍيل هوندو آهي، RGA کي مستحڪم ڪرڻ لاءِ H2A-RGA-TF ڪمپليڪس ٺاهيندو آهي. هڪ نامعلوم ڪائنس ذريعي DELLA ڊومين ۽ GRAS ڊومين جي وچ ۾ PolyS/T علائقي ۾ Pep 2 جو فاسفوريليشن RGA-H2A بائنڊنگ کي وڌائيندو آهي. rgam2A ميوٽنٽ پروٽين RGA فاسفوريليشن کي ختم ڪري ٿو ۽ H2A بائنڊنگ ۾ مداخلت ڪرڻ لاءِ هڪ مختلف پروٽين ڪنفارميشن کي اختيار ڪري ٿو. ان جي نتيجي ۾ عارضي TF-rgam2A رابطي جي عدم استحڪام ۽ rgam2A کي ٽارگيٽ ڪروميٽين کان الڳ ڪرڻ جو نتيجو نڪرندو آهي. هي انگ صرف RGA-ثالث ٽرانسڪرپشنل ريپريشن کي ڏيکاري ٿو. RGA-ثالث ٽرانسڪرپشنل ايڪٽيويشن لاءِ ساڳيو نمونو بيان ڪري سگهجي ٿو، سواءِ ان جي ته H2A-RGA-TF ڪمپليڪس ٽارگيٽ جين ٽرانسڪرپشن کي فروغ ڏيندو ۽ rgam2A جو ڊيفاسفوريليشن ٽرانسڪرپشن کي گهٽائيندو. هوانگ ۽ ٻين کان تبديل ٿيل شڪل.21.
سڀني مقداري ڊيٽا جو شمارياتي طور تي ايڪسل استعمال ڪندي تجزيو ڪيو ويو، ۽ شاگردن جي ٽي ٽيسٽ استعمال ڪندي اهم فرق طئي ڪيا ويا. نموني جي سائيز کي ابتدائي طور تي طئي ڪرڻ لاءِ ڪو به شمارياتي طريقو استعمال نه ڪيو ويو. تجزيو مان ڪو به ڊيٽا خارج نه ڪيو ويو؛ تجربو بي ترتيب نه ڪيو ويو؛ محقق تجربي دوران ڊيٽا جي ورڇ ۽ نتيجن جي تشخيص کان بي خبر نه هئا. نموني جي سائيز شڪل جي ليجنڊ ۽ سورس ڊيٽا فائل ۾ ظاهر ڪئي وئي آهي.
مطالعي جي ڊيزائن بابت وڌيڪ معلومات لاءِ، هن مضمون سان لاڳاپيل قدرتي پورٽ فوليو رپورٽ خلاصو ڏسو.
ماس اسپيڪٽروميٽري پروٽومڪس ڊيٽا کي ڊيٽا سيٽ سڃاڻپ ڪندڙ PXD046004 سان PRIDE66 پارٽنر ريپوزٽري ذريعي پروٽيم ايڪسچينج ڪنسورشيم ۾ شامل ڪيو ويو آهي. هن مطالعي دوران حاصل ڪيل ٻيا سڀئي ڊيٽا ضمني معلومات، ضمني ڊيٽا فائلن، ۽ خام ڊيٽا فائلن ۾ پيش ڪيا ويا آهن. هن مضمون لاءِ ماخذ ڊيٽا مهيا ڪيو ويو آهي.

 

پوسٽ جو وقت: نومبر-08-2024